PrimerPlex

      PrimerPlex官方版是一款设计非常专业的多重PCR引物设计软件，PrimerPlex官方版拥有直观的操作界面，其软件主要用于基因表达分析、PCR引物设计、SNP检测和高吞吐量基因分析、综合检测等，非常的简单实用。

功能介绍

      1、多重SNP检测和高吞吐量基因分型

      使用PrimerPlex，您可以设计在SNP侧翼的多重PCR引物，3'末端具有SNP的ASPE引物，并在其中心捕获具有SNP的探针。 PrimerPlex可以通过为每个基因组序列设计寡核苷酸来检测中等大小的基因组序列的所有突变。检查这些引物和探针的多重性，并显示最佳可能的集合。

      2、多重PCR引物设计

      设计适用于多重测定的引物组可能是一项具有挑战性的任务。 PrimerPlex使用创新和专有的算法来设计最佳多路复用引物组，从而最大限度地减少Tm失配。分析所有组的交叉反应性，以确保特异性和有效的扩增。您可以从以不同排序顺序呈现的替代品列表中选择最适合您实验需要的套件。使用PrimerPlex，您可以灵活地将引物设计成3'端，5'端，距离这些末端或序列内任何地方都有特定的距离。

      对于SNP基因分型测定，该程序设计侧翼突变的引物，如SNP，DIP(缺失/插入多态性)和MNP(多核苷酸多态性)。

      3、综合检测支持

      使用PrimerPlex，设计寡核苷酸用于多重PCR，ASPE和直接杂交测定。寡核苷酸被筛选为交叉反应性，以确保高信号强度，使Tm失配最小化。寡核苷酸被筛选为二聚体，运行和重复。

      4、下一代测序法

      使用PrimePlex，设计用于预先测序样品制备和突变检测的多重寡核苷酸，如SNP，DIP(缺失/插入多态性)和MNP(多核苷酸多态性)与点击几个按钮一样简单。

      5、引物特异性

      程序BLAST在单次搜索运行中搜索多个序列。结果自动解释，并且在引物设计期间避免了识别的同源性，确保设计具有高度的特异性。

      6、评估预先设计的引物和探针

      PrimerPlex可以使用预先设计良好的寡核苷酸来构建多重集合。在为每个序列指定寡核苷酸后，分析其属性，并向用户发出所发现的任何偏差。对于预先设计的寡核苷酸不可用的序列，PrimerPlex设计它们，检查它们的多重性，并突出显示兼容性问题(如果有的话)。然后，用户可以决定接受设计或创建单独的池。该功能可以完全控制用户手中。

      7、添加MagPlex标签

      该程序现在还支持MagPlex TAG数据库以及MicroPlex xTAG(以前称为FlexMAP TAG)，用于在每个ASPE引物上自动添加适当的标签。标签被选择为使得它们最小化二聚化，并且不折叠在它们所连接的寡核苷酸上。此外，用户可以覆盖程序的建议，并自行选择一个标签。如果标签不是唯一的，或者选择的标签与oligo不兼容，PrimerPlex会提醒用户。