Arlequin

Arlequin

3.5.2.2官方正式版
  • 软件大小:18.2 MB
  • 更新时间:2019-06-24
  • 系统类型:支持32/64位
  • 星级指数:5
  • 软件平台:电脑版
  • 下载次数:230次
  • 安全监测:无插件无病毒正式版
  • 软件语言:简体中文
  • 操作系统:WinXp/Win2003/WinVista/Win7/Win8/Win10
  • 增加安全防护与软件管理功能

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软件简介

      Arlequin正式版是一款专门为人类遗传学数据而设计的软件,Arlequin正式版界面简洁大方,功能强劲实用,且操作十分简单,其软件的目的主要在于从事医学、生物学研究的用户设计,且软件可进行AMOVA计算、中性检验、错配分布等。


Arlequin软件特色

      1.Molecular diversity(分子多态性);

      2.Mismatch distribution(错配分布);

      3.Haplotype frequency estimation(单倍型频率估计);

      4.Linkage disequilibrium(连锁不平衡:检测不同位点上等位基因的非随机关联);

      5.Hardy-Weinberg equilibrium(哈温—伯格平衡);

      6.Tajima`s neutrality test(Tajima中性检验);

      7.Fu`s neutrality test(Fu中性检验);

      8.Ewens-watterson neutrality test(Ewens-watterson中性检验);

      9.Chakraborty`s amalgamation test (Chakraborty`s 融合检验,检测人群的均一性或同质性和中性选择等);

      10.Minimu Spanning Network(最小扩张树或称之为最小支撑树,,基于分子差异);

      11.AMOVA 分子差异度分析,用以评测人群的遗传结构;

      12.Pairwise genetic distances (遗传距离的估计);

      13.Exact test of population differentiation (检测随机交配群体单倍型的非随机分布);

      14.Assignment test of genotype (通过估计等位基因频率将单个基因型分配到特定的人群中);

Arlequin官方电脑端更新日志

      Arlequin 正式版 3.5.2.2

      1.直接从DNA序列数据计算位点频谱,但仅基于次要等位基因频谱的SFS计算。

      2.无法打开批处理(.arb)文件。

      3.当(假设祖先等位基因0)在一个站点不存在时,SFS计算不良。

      4.由arlequin和fastsimcoal2生产的不同SFS(主要用于基于MAF的SFS)。

      5.如果文件名超过255个字符,则会出错。

      6.在arlequin日志文件中没有提到SFS计算。

提示:软件图集是通过Arlequin官网或软件客户端截图获取,主要用于分享软件价值,如有侵权请联系我们!

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