MEGA进化树

MEGA进化树

  • 版本:v7.0.26
  • 大小:30.8MB
  • 更新:2024-11-13
  • 下载:4397次
  • 语言:简体中文
  • 授权:免费
  • 评分:5
  • 系统:winall/win7/win10/win11
杀毒检测:无插件360通过金山通过

软件简介

MEGA进化树       MEGA进化树官方版是一款功能极为强大的分子进化遗传分析软件,MEGA进化树官方版全称:Molecular Evolutionary Genetics Analysis。它是一款专业的进化树软件,用于分析来自物种和种群的DNA和蛋白质序列数据,可用于序列比对、进化树推断、估计分子进化速度、验证进化假说等。

MEGA进化树

MEGA进化树软件特色

  1、【序列分析】

  系统发育推论

  型号选择

  约会和时钟

  祖传国家

  选择和测试

  序列比对

  2、【统计方法】

  最大似然

  距离方法

  普通最小二乘

  最大的简约

  复合似然

  贝叶斯

  3、【强大的视觉工具】

  对齐/跟踪编辑器

  树探索者

  数据探索者

  传奇发电机

  基因复制向导

  时间树向导

MEGA进化树安装步骤

  1.双击打开软件,点击下一步

MEGA进化树

  2.选择安装路径

MEGA进化树

  3.等待安装完成就可以使用了

MEGA进化树

MEGA进化树官方电脑端使用方法

  1、首先根据提示安装好软件之后,准备需要建树的序列,并将序列保存为fasta格式。

  2、打开MEGA7,点击Align--Edit/built Alignment,选择Create a new alignment,点击ok。

  3、打开刚刚保存下来的fasta序列。

  4、点击Alignment –Align by ClustalW ,选择所有序列,出现下图,参数根据需求修改,在这我们就直接选择默认,点击ok。

  5、比对完成后,点击Data –Phylogenetic Analysis,出现下图坐标箭头指向的两个按钮。

  6、点击Phylogeny,有5个构建进化树的方法,一般选择MaximumLikehood(最大似然法)、Neighbor-Joining(邻接法)和Minimum-Evolution(最小进化法)方法,在此选择选择Neighbor-Joining(邻接法)建树。

  7、在Test of Phylogeny 选择Bootstrapmethod; No.ofBootstrap replications 输入2000; Mode/Method 核酸选择Maximum Composite Likehood, 氨基酸序列选择Poisson model; Rates among sites 选择Uniform rates; Gaps/Missing Data Treatment 选择Compeledeletion, 点击Compute得到下面结果,根据自己的需求对树进行修饰。

软件图集

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